Đặc điểm gen độc lực, phân nhóm phát sinh loài và sự đề kháng sinh của vi khuẩn Eschrichia Coli sinh β-lactamase phổ rộng phân lập từ thịt và tôm bán lẻ tại Nha Trang, Việt Nam

11 lượt xem

Thực phẩm có nguồn gốc từ động vật được xem là một trong những nguồn tiềm ẩn chứa vi khuẩn gây bệnh, trong đó có vi khuẩn Escherichia coli. Tuy nhiên, ở Việt Nam, có rất ít nghiên cứu về vi khuẩn sinh β-lactamase phổ rộng (ESBL) phân lập từ thực phẩm cũng như các đặc trưng phân tử của chúng. Nghiên cứu này được thực hiện để xác định một số đặc...

Tóm tắt tiếng Việt: Thực phẩm có nguồn gốc từ động vật được xem là một trong những nguồn tiềm ẩn chứa vi khuẩn gây bệnh, trong đó có vi khuẩn Escherichia coli. Tuy nhiên, ở Việt Nam, có rất ít nghiên cứu về vi khuẩn sinh β-lactamase phổ rộng (ESBL) phân lập từ thực phẩm cũng như các đặc trưng phân tử của chúng. Nghiên cứu này được thực hiện để xác định một số đặc điểm sinh học phân tử của vi khuẩn E.coli sinh ESBL (E-ESBL) phân lập từ 350 mẫu thực phẩm bao gồm thịt gia cầm (n=143), thịt lợn (n=147) và tôm (n=60). 142 chủng E-ESBL được sử dụng để phân tích kiểu gen β-lactamase, đặc điểm phát sinh loài, đặc điểm gen độc lực và sự đề kháng kháng sinh. Tỷ lệ nhiễm E-EBSL trong thịt gia cầm, thịt lợn và tôm lần lượt là 58,7%, 32,0% và 18,3%. Gen mã hóa β-lactamase thuộc nhóm CTX-M-1 (50,7%), CTX-M-9 (41,5%), TEM (59,9%) và SHV (2,8%) được phát hiện ở dạng riêng lẻ hoặc ở dạng kết hợp với nhau. Phần lớn các chungrE-ESBL (53,5%) thuộc nhóm phát sinh loài B1, một số ít thuộc nhóm A (23,2%), D (19%) và B2 (4,2%). Phát hiện có 01 chủng (0,7%) thuộc nhóm E.coli sinh độc tố ruột (ETEC), 02 chủng (1,4%) thuộc nhóm E. coli gây bệnh đường ruột không đặc trưng (aEPEC) và 39 chủng (27,5%) E.coli mang gen sinh độc tố tuột chịu nhiệt nhóm 1 (EAST1) dựa trên các gen độc lực elt, eaeA và astA mà chúng sở hữu. Tỷ lệ đa kháng kháng inh (kháng ≥3 nhóm kháng sinh) ở các chủng E-ESBL là 85,9%.

English summary: Anmal-based food is considered to be one of the potential reservoir for pathogenic bacteria, including Escherichia coli. However, little is known in Vietnam about the extent of contamination of food with extended spectrum β-lactamase (ESBL)- producing bateria as well as their molecular characteristics. This study was conducted to assess molecular charateristics of the ESBL – producing E.coli strains (E-ESBL) isolated from 350 retail food samples, including poultry (n=143), pork (n=147), and shrimp (n=60). A total of142 E-ESBL isolated were determined for β-lactamase genotypes, phylogroups, diarrhea-related virulence genes, and antibiotic resistance profiles. The prevalence of E-ESBLs were 58.7%, 32.0% and 18.3% for poultry, pork and shrimp, respectively. β-lactamase-encoding genes of the CTX-M-1 (50.7%), CTX-M-9 (41.5%), TEM (59.9%), and SHV (2.8%) groups were detected singly or in combination. Most of the E-ESBL isolates (53.5%) belonged to phylogroups B1 followed by A (23.2%), D (19.0%) and B2 (4.2%). One E-ESBL (0.7%) was confirmed for enterotoxigenic E. coli (ETEC), two (1.4%) for atypical enteropathogenic E. coli i (aEPEC), and 39 (27.5%) for E.coli producing enteroaggregative E.coli heat – stable enterotoxin – 1 (EAST1) due to their possession of elt, eaeA and astA genes. The proportion of multi-drug resistance in E-ESBL isolates from retail meats and shrimp was 85.9%.