Đặc điểm phân tử của chủng vi khuẩn Escherichia Coli sinh ESBL phân lập từ một số mẫu thực phẩm tại Thái Bình
Nghiên cứu nhằm đánh giá kiểu gen mã hóa ESBL và phân nhóm
phát sinh loài của 367 chủng E. coli sinh ESBL phân lập từ 253 mẫu thực phẩm (thịt
lợn, thịt gà, tôm, cá) thu thập tại Thái Bình (từ 6/2013- 12/2014). Kiểu gen mã
hóa ESBL được phân tích bằng kỹ thuật multiplex PCR xác định trình tự của các
gen CTX – M, TEM và SHV. Phân nhóm phát sinh...
Tóm tắt tiếng Việt: Nghiên cứu nhằm đánh giá kiểu gen mã hóa ESBL và phân nhóm
phát sinh loài của 367 chủng E. coli sinh ESBL phân lập từ 253 mẫu thực phẩm (thịt
lợn, thịt gà, tôm, cá) thu thập tại Thái Bình (từ 6/2013- 12/2014). Kiểu gen mã
hóa ESBL được phân tích bằng kỹ thuật multiplex PCR xác định trình tự của các
gen CTX – M, TEM và SHV. Phân nhóm phát sinh loài cũng được đánh giá bằng kỹ
thuật multiplex PCR với các cặp mồi đặc hiệu cho gen Chu A, YjaA và trình tự
TspE4C2. Kết quả cho thấy 96,7% số chủng E. coli sinh ESBL mang gen CTX – M và
59,9% số chủng mang gen TEM. Gen CTX-M lưu hành rất phổ biến ở các chủng E. coli sinh ESBL phân lập từ thực phẩm và là nguyên nhân chủ yếu gây ra tình trạng
kháng thuốc ở vi khuẩn E. coli hiện nay.
English summary: The study aimed to evaluate the genotype and phynogeny of
367 ESBL – producing E. coli strains isolated from 253 food samples (pork,
chicken meat, shirmp, fish) collected in Thai Binh (from June 2013 to December
2014). ESBLs coding genes were examined with the use of a multiplex PCR that
detects specific sequences of CTX-M, TEM and SHV genes. Phylogenetic analysis
was also accomplished by another multiplex PCR with specific primer pairs for
Chu A, yjaA and TspE4C2 sequences. Results showed that 96.7% of ESBL producing E. coli contained CTX-M gene and 59.9% contained TEM gene. CTX-M gene was in
common circulation in ESBL producing E. coli isolated from food and was the main
cause of current drug resistance among E. coli.
English summary: The study aimed to evaluate the genotype and phynogeny of
367 ESBL – producing E. coli strains isolated from 253 food samples (pork,
chicken meat, shirmp, fish) collected in Thai Binh (from June 2013 to December
2014). ESBLs coding genes were examined with the use of a multiplex PCR that
detects specific sequences of CTX-M, TEM and SHV genes. Phylogenetic analysis
was also accomplished by another multiplex PCR with specific primer pairs for
Chu A, yjaA and TspE4C2 sequences. Results showed that 96.7% of ESBL producing E. coli contained CTX-M gene and 59.9% contained TEM gene. CTX-M gene was in
common circulation in ESBL producing E. coli isolated from food and was the main
cause of current drug resistance among E. coli.