An toàn thực phẩm là lĩnh vực chuyên môn của Viện Dinh dưỡng tập trung vào kiểm soát chất lượng, vệ sinh và giá trị dinh dưỡng của thực phẩm nhằm giảm thiểu nguy cơ đối với sức khỏe người tiêu dùng.

Hoạt động của lĩnh vực này bao gồm nghiên cứu khoa học về vệ sinh an toàn thực phẩm, phát triển và ứng dụng kỹ thuật kiểm nghiệm, đào tạo nguồn nhân lực, chỉ đạo tuyến và truyền thông giáo dục sức khỏe. Bên cạnh đó, Viện còn phối hợp xây dựng tiêu chuẩn, quy định pháp lý và mở rộng hợp tác quốc tế nhằm tiếp cận các thành tựu khoa học tiên tiến trong kiểm soát an toàn thực phẩm.

Viện cũng triển khai các hoạt động chỉ đạo tuyến về kỹ thuật kiểm nghiệm, giám sát nguy cơ và ngộ độc thực phẩm; phối hợp truyền thông giáo dục về vệ sinh an toàn thực phẩm trên phạm vi cả nước; và đẩy mạnh hợp tác quốc tế để tiếp cận các tiến bộ khoa học trong lĩnh vực này.